Молекулярная биофизика

Молекулярная биофизика

2.1. Пространственная организация биополимеров.

Макромолекула как основа организации биоструктур. Пространственная конфигурация биополимеров. Статистический характерконформации биополимеров.

Условия стабильности конфигурации макромолекул. Фазовые переходы. Переходы глобула- клубок. Кооперативные свойства макромолекул. Типы объемных взаимодействий в белковыхмакромолекулах. Водородные связи: силы Ван-дер-Ваальса; электростатические взаимодействия; поворотная изомерия и энергия внутреннего вращения. Расчет общей конформации энергии биополимеров.

Факторы стабилизациимакромолекул, надмолекулярных структур и биомембран.

Взаимодействие макромолекул с растворителем. Состояние воды и гидрофобные взаимодействия в биоструктурах. Переходы спираль-клубок.

Особенности пространственнойорганизации белков и нуклеиновых кислот. Модели фибриллярных и глобулярных белков. Количественная структурная теория белка.

2.2. Динамические свойства глобулярных белков.

Структурные иэнергетические факторы, определяющие динамическую подвижность белков. Гиперповерхности уровней конформационной энергии.

Динамическая структура олигопептидов и глобулярных белков; конформационная подвижность. Методыизучения конформационной подвижности: изотопный обмен, люминесцентные методы, ЭПР, гамма- резонансная спектроскопия, ЯМР высокого разрешения, импульсные методы ЯМР, методы молекулярной динамики. Авто- икросскорреляционные функции торсионных углов и межатомных расстояний. Карты уровней свободной энергии пептидов.

Результаты исследования конформационной подвижности. Ограниченная диффузия. Типы движения вбелках. Иерархия амплитуд и времен релаксации конформационных движений. Связь характеристик конформационной подвижности белков с их функциональными свойствами. Динамика электронно-конформационныхпереходов. Роль воды в динамике белков. Роль конформационной подвижности в формировании ферментов и транспортных белков.

2.3. Электронные свойства...